Kiedy czytamy historię z czasów powstania styczniowego, dowiadujemy się m.in. o kasacie klasztoru i konwentu paulińskiego we Włodawie. Wojska powstańców przeszły przez Włodawę 7 marca 1863 r. i kierując się wzdłuż rzeki Włodawki, zatrzymały się na odpoczynek w rejonie wsi Adamki. Wkrótce w ten rejon dotarły oddziały rosyjskie; prawdopodobnie Rosjanie uzyskali dokładne informacje o miejscu stacjonowania Polaków. Rozpoczęła się dwugodzinna walka, która wobec znacznej przewagi nieprzyjaciela, posiadającego kilka kompanii piechoty oraz oddział kozaków, zakończyła się klęską Polaków. Z informacjami o powstaniu na Lubelszczyźnie, publikacjami i zdjęciami pomników i krzyży na miejscach bitewnych można zapoznać się, oglądając wystawę we włodawskiej bibliotece miejskiej.
Za czynny udział i pomoc w powstaniu styczniowym został skasowany w 1864 r. ukazem carskim klasztor włodawskich paulinów, ufundowany w 1698 r. przez Ludwika Pocieja. Klasztor przeznaczono na cele urzędów wojskowych, miejskich i powiatowych; stan ten trwał do 1993 r. Dzięki usilnym prośbom paulinów klasztor wraz z kościołem został zwrócony prawowitym właścicielom. Dopiero w 1999 r. wszystkie urzędy miejskie wyprowadzono z budynku, który przez lata był pozbawiony gruntownych remontów. W 2000 r. paulini przystąpili do prac remontowo-konserwatorskich przy obiekcie klasztornym. Prace trwają nieprzerwanie. W ostatnich miesiącach w kościele św. Ludwika odrestaurowano tzw. baldachimy w prezbiterium na sumę 10 tys. zł, a 15 tys. zł dopłacono do renowacji chrzcielnicy. Dotacja od konserwatora zabytków w wysokości 10 tys. zł posłuży do renowacji ambony; na dokończenie tego dzieła w bieżącym roku potrzebne jest jeszcze 35 tys. zł. Wolontariuszki, które w ubiegłym roku odwiedziły domy parafian, zebrały kwotę 8 tys. zł; pieniądze te przeznaczono na renowację feretronu Matki Bożej Częstochowskiej. Zakonnicy w różny sposób zabiegają o przyczynienie się do odnowienia kościoła i klasztoru, m.in. przeor o. Jan Bednarz nagrał płyty CD z pieśniami maryjnymi.